Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp4bQ8C6J9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Nlrp4bQ8C6J9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Nlrp4bQ8C6J9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Nlrp4bQ8C6J9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Nlrp4bQ8C6J9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nlrp4bQ8C6J9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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