Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0D0

Trub1, Probable tRNA pseudouridine synthase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub1Q8C0D0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trub1Q8C0D0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trub1Q8C0D0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms