Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Iffo1Q8BXL9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Iffo1Q8BXL9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Iffo1Q8BXL9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Iffo1Q8BXL9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Iffo1Q8BXL9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Iffo1Q8BXL9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Iffo1Q8BXL9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Iffo1Q8BXL9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Iffo1Q8BXL9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Iffo1Q8BXL9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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