Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms