Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cldn17Q8BXA6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cldn17Q8BXA6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cldn17Q8BXA6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cldn17Q8BXA6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cldn17Q8BXA6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Cldn17Q8BXA6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cldn17Q8BXA6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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