Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gga3Q8BMI3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gga3Q8BMI3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms