Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF3

Me3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me3Q8BMF3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Me3Q8BMF3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Me3Q8BMF3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms