Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Usp54Q8BL06 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp54Q8BL06 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms