Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH15

Cnot10, CCR4-NOT transcription complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot10Q8BH15 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnot10Q8BH15 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms