Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smndc1Q8BGT7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms