Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Atg4bQ8BGE6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Atg4bQ8BGE6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Atg4bQ8BGE6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Atg4bQ8BGE6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Atg4bQ8BGE6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Atg4bQ8BGE6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atg4bQ8BGE6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms