Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg2bQ80XK6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms