Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc28Q80XJ3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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