Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
NischQ80TM9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NischQ80TM9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NischQ80TM9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
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