Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LnpkQ7TQ95 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms