Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Actn1Q7TPR4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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