Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrc2bQ7TPM1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prrc2bQ7TPM1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms