Protein–RNA interactions for Protein: Q793I8

Tifa, TRAF-interacting protein with FHA domain-containing protein A, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TifaQ793I8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TifaQ793I8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms