Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smim12Q78RX3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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