Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd3eapQ76KJ5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cd3eapQ76KJ5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms