Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ncapd3Q6ZQK0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncapd3Q6ZQK0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms