Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

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Length 3,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Usp34Q6ZQ93 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp34Q6ZQ93 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Usp34Q6ZQ93 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp34Q6ZQ93 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usp34Q6ZQ93 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Usp34Q6ZQ93 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp34Q6ZQ93 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usp34Q6ZQ93 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Usp34Q6ZQ93 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Usp34Q6ZQ93 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Usp34Q6ZQ93 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Usp34Q6ZQ93 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp34Q6ZQ93 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Usp34Q6ZQ93 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Usp34Q6ZQ93 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp34Q6ZQ93 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp34Q6ZQ93 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Usp34Q6ZQ93 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp34Q6ZQ93 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp34Q6ZQ93 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp34Q6ZQ93 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp34Q6ZQ93 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp34Q6ZQ93 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp34Q6ZQ93 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp34Q6ZQ93 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp34Q6ZQ93 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp34Q6ZQ93 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp34Q6ZQ93 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp34Q6ZQ93 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp34Q6ZQ93 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms