Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cnot1Q6ZQ08 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Cnot1Q6ZQ08 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms