Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc88cQ6VGS5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms