Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sarm1Q6PDS3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sarm1Q6PDS3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms