Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A1

Stmnd1, Stathmin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stmnd1Q6P3A1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Stmnd1Q6P3A1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms