Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc3bQ6NWW9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc3bQ6NWW9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fndc3bQ6NWW9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc3bQ6NWW9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc3bQ6NWW9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc3bQ6NWW9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc3bQ6NWW9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc3bQ6NWW9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc3bQ6NWW9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc3bQ6NWW9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc3bQ6NWW9 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc3bQ6NWW9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc3bQ6NWW9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc3bQ6NWW9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc3bQ6NWW9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc3bQ6NWW9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc3bQ6NWW9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc3bQ6NWW9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc3bQ6NWW9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc3bQ6NWW9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc3bQ6NWW9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc3bQ6NWW9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fndc3bQ6NWW9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fndc3bQ6NWW9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fndc3bQ6NWW9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fndc3bQ6NWW9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fndc3bQ6NWW9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fndc3bQ6NWW9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms