Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HelbQ6NVF4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HelbQ6NVF4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms