Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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