Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt40Q6IFX3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt40Q6IFX3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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