Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg9bQ6EBV9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms