Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Smarca2Q6DIC0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Smarca2Q6DIC0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms