Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Pram1Q6BCL1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pram1Q6BCL1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms