Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Cep290Q6A078 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Cep290Q6A078 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Cep290Q6A078 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Cep290Q6A078 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Cep290Q6A078 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Cep290Q6A078 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cep290Q6A078 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cep290Q6A078 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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