Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk13Q69ZA1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk13Q69ZA1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms