Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CltcQ68FD5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CltcQ68FD5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms