Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ino80dQ66JY2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ino80dQ66JY2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms