Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT5

Tpgs2, Tubulin polyglutamylase complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs2Q66JT5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tpgs2Q66JT5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tpgs2Q66JT5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms