Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CochQ62507 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CochQ62507 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CochQ62507 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CochQ62507 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CochQ62507 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CochQ62507 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CochQ62507 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CochQ62507 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CochQ62507 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CochQ62507 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CochQ62507 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CochQ62507 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CochQ62507 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CochQ62507 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CochQ62507 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CochQ62507 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CochQ62507 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CochQ62507 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CochQ62507 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CochQ62507 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CochQ62507 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CochQ62507 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CochQ62507 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CochQ62507 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CochQ62507 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CochQ62507 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CochQ62507 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CochQ62507 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CochQ62507 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CochQ62507 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CochQ62507 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CochQ62507 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CochQ62507 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CochQ62507 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CochQ62507 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CochQ62507 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CochQ62507 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CochQ62507 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CochQ62507 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CochQ62507 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CochQ62507 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CochQ62507 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CochQ62507 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CochQ62507 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CochQ62507 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CochQ62507 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CochQ62507 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CochQ62507 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CochQ62507 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CochQ62507 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CochQ62507 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CochQ62507 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CochQ62507 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CochQ62507 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CochQ62507 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CochQ62507 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CochQ62507 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CochQ62507 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CochQ62507 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CochQ62507 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CochQ62507 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CochQ62507 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CochQ62507 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CochQ62507 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CochQ62507 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CochQ62507 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CochQ62507 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CochQ62507 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CochQ62507 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CochQ62507 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CochQ62507 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CochQ62507 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CochQ62507 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CochQ62507 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CochQ62507 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CochQ62507 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CochQ62507 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CochQ62507 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CochQ62507 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CochQ62507 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CochQ62507 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CochQ62507 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CochQ62507 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CochQ62507 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CochQ62507 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CochQ62507 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CochQ62507 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CochQ62507 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CochQ62507 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CochQ62507 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CochQ62507 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CochQ62507 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CochQ62507 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CochQ62507 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CochQ62507 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CochQ62507 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CochQ62507 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CochQ62507 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CochQ62507 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms