Protein–RNA interactions for Protein: Q62458

Gm20809, (clone BALB14N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20809Q62458 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20809Q62458 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20809Q62458 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20809Q62458 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20809Q62458 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20809Q62458 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20809Q62458 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20809Q62458 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20809Q62458 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm20809Q62458 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms