Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

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Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtmQ62388 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtmQ62388 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtmQ62388 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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AtmQ62388 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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AtmQ62388 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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AtmQ62388 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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AtmQ62388 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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AtmQ62388 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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AtmQ62388 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtmQ62388 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
AtmQ62388 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AtmQ62388 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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