Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema5aQ62217 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema5aQ62217 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms