Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

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Length 661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Cd180Q62192 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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Cd180Q62192 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd180Q62192 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Cd180Q62192 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Cd180Q62192 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Cd180Q62192 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd180Q62192 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms