Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SnrpaQ62189 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms