Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttf1Q62187 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ttf1Q62187 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ttf1Q62187 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ttf1Q62187 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ttf1Q62187 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ttf1Q62187 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ttf1Q62187 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ttf1Q62187 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ttf1Q62187 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ttf1Q62187 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttf1Q62187 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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