Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sin3bQ62141 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sin3bQ62141 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms