Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsx2Q61412 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms