Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2bQ61313 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tfap2bQ61313 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms