Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a1Q61165 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a1Q61165 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a1Q61165 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a1Q61165 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a1Q61165 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a1Q61165 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a1Q61165 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a1Q61165 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a1Q61165 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a1Q61165 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a1Q61165 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a1Q61165 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a1Q61165 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a1Q61165 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a1Q61165 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a1Q61165 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a1Q61165 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a1Q61165 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a1Q61165 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a1Q61165 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Slc9a1Q61165 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc9a1Q61165 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc9a1Q61165 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc9a1Q61165 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc9a1Q61165 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc9a1Q61165 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc9a1Q61165 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc9a1Q61165 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc9a1Q61165 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc9a1Q61165 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Slc9a1Q61165 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Slc9a1Q61165 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms