Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf3Q60980 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms